Добрый день.
С такой проблемой столкнулся:
на клиентской станции имеем настройки прокси в ИЕ (выполнены через свойства самого ИЕ, не через gpedit).
В дереве делаем политику (настройки безопасности, брэндмауэр, WSUS и прочее). Всё, что касается настроек прокси ИЕ, в политике не трогаем.
Применяю политику на OU. После логина пользователя групповая политика применяется, но все настройки прокси ИЕ уходят (становятся дефолтными). Это 'as design'? В доке что-то не смог найти по этому моменту.