У меня была ситуация с точностью до наоборот (в смысле эффекта от перехода на другие карты):
На сервере стояла Compex, такие же проблемы + частенько отваливался диск со сложной структурой папок(длинные русские), могли отваливаться и другие. Локализовать траблу по активному оборудованию/клиентам тоде не удавалось, хотя чаще происходило на 10Мбит хабах левых производителей. Было принято решение по оптимизации топологии с заменой кое-какого акт оборудования и установка на сервер транка из 2-х Intel Pro/100.
Еще во время тестирования (файло гонял ночью) старой карточки выявились траблы оч похожие на Ваши
Копирование файлов с серверов идет стандартно, но подготовка к копированию практически замирает.
Дико обрадовался и уже собрался запулить карточку в мусорку, но... Когда разобрал сервак (и охренел, увидев,
какая сетевуха там стояла), попутно обнаружилось - стоял вентиль на i960 на Raid контроллере, к радиатору нельзя было прикоснуться. Взял напильник, радиатор от целика (для четверки не было, а любой другой - не идет), сделал 2 пружины... Поставил карточки, наладил транк... Все заработало.
До сих пор гадаю - хто виноват - перегрев проца или левая карта (ее еще до меня поставили взамен сгоревшей 3с905, и благополучно забыли).
Вот так бывает... А у Вас - ИМХО может быть нестыковка карт с мутатором (не любят эти фирмы друг друга). Попробуйте поиграться с технологиями объединения портов, просто поперебирать их...
С уважением, Сергей.