Может быть я упустил, для меня это очевидное правило.
Мастера надо перевести на живой сервер, а потом уже чего-то ломать в дереве.
В предложенной технологии существует период, когда два сервера работают вместе, вот тогда и перевести. Даже если этого не сделать, реплика и с мертвого переводится DSREPAIR ом. А потом уж грохайте.
Опять таки старый остается жив, только что с R/W репликой. Можно будет и вернуть в случае аварии.